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增强子控制基因表达二聚化,以允许增强子启动子相互作用

来源:大连空压机排风系统 作者:大连空压机价格 时间:2020-06-24 13:35 点击量:

12月31日,《美国国度科学院院刊》 (PNAS)在网上发表了一篇名为《人与Sbp2复合物中Ldb1的晶体结构》的论文。这项工作由中国科学院生物物理研究所许/梁课题组和国家卫生研究院安院长课题组共同完成。

附加元件是一小段可以与蛋白物质相连的DNA。与蛋清物质相连后,基因的转录效应将增强。增强子可以位于基因的上游或下游。此外,这种差异与受影响的基因很接近,甚至这种差异与基因位于同一条染色体上。这是因为染色质的缠结排列使得序列中遥远的位置相互接触成为可能。

增强子是控制基因表达与否的开关。它们通常远离它们控制的基因,并位于编码框架之外。因此,增强子和远离基因的基因之间的DNA环是基因转录和激活中非常关键的一步。在哺乳动物红细胞中,卵生白LDB1不与DNA本身相连,但为了区分与长距离增强子和红细胞生成相关基因相连的LDB1转录复合物,长距离增强子和启动子之间的相互作用可以通过LDB1的二聚化来实现。LDB1-SSBP复合物是许多主要蛋清复合物的焦点复合物,例如Wnt增强子复合物和LDB1转录复合物,其对发育至关重要。SSBP蛋清防止26S蛋清酶体中LDB1蛋清被大连空气压缩机配件制造商降解,保持LDB1复合物的完整性,进一步促进转录复合物的组装并调节基因表达。然而,低密度脂蛋白B1如何与SSBP相互作用以及低密度脂蛋白B1如何形成同型二聚体的分子机制尚未揭示。

增强子可分为细胞特异性增强子和诱导性增强子:组织和细胞特异性增强子。许多增强子在增强效应中具有很高的组织细胞特异性,其功能只能在特定转录因子(蛋清物质)的干预下发挥。诱导增强子。这种增强子的活性通常需要特定启动子的介入。例如,金属硫蛋白基因可在多种组织细胞中转录,并可由类固醇激素、锌、镉和生长因子诱导以提高转录水平。

本文报道了LDB1/SSBP2配合物的晶体结构。作者发现,LDB1二聚体布局结构域(DD)包括一个N末端核转运因子2(NTF2)模式结构域和一个由螺旋4和螺旋5组成的亚结构结构域,它们共同形成LDB1二聚体相互作用表面。LDB1二聚体的两个LDB1芯片保守结构域(LCCD)位于焦点二聚体的一侧,并且每个LCCD和SSBP2二聚体彼此形成共同的相互作用。LDB1dd和LCCD之间的保守接头笼覆盖了ldblnf2样亚结构结构域的潜在配体结合囊,其可能成为ldbl结构和功能的调节位点。此外,本文中的结构和生化数据为理解LDB1和LDB1/SSBP2之间的相互作用如何成为调节细胞选择决定和长距离增强子-启动子相互作用的分歧复合体的结构焦点提供了基础。

启动子是由核糖核酸聚合酶识别、连接和转录的一段脱氧核糖核酸序列。它包含核糖核酸聚合酶特异性连接和转录起始所需的保守序列。大多数位于结构基因转录起始点的上游,启动子本身不被转录。然而,一些启动子(例如tRNA启动子)位于转录起始点的下游,并且这些DNA序列可以被转录。启动子的特征最初是由能够增加或降低基因转录速率的突变决定的。启动子也位于转录起始位点的上游。

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